Climate change intensifies rapid genomic selection beyond the ancestral niche of Fagus sylvatica
この研究は、気候変動がブナ（Fagus sylvatica）に祖先の生息域を超えるような急速なゲノム選択を促していることを示す一方で、排出量シナリオによってはその進化速度が気候変動の速度に追いつかず、森林の適応限界が脅かされる可能性を明らかにしています。
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evolutionary biology
460 件の論文
Cellular transcriptomics reveals evolutionary adaptation and rumination of vertebrate stomachs
この論文は、23 種の脊椎動物の単細胞および空間トランスクリプトミクス解析を通じて、草食への適応に伴う胃の多様化の細胞・分子基盤を解明し、特に反芻運動に不可欠な遺伝子（例：LUC7L）を同定することで、単胃動物への反芻機能の付与や胃運動障害の治療への新たな道筋を示しました。
Characterizing Physicochemical Selection in Protein Evolution with Property-Informed Models (PRIME)
本研究は、アミノ酸の物理化学的性質を明示的に組み込んだ新しい進化モデル「PRIME」を開発し、従来のモデルでは捉えきれなかったタンパク質進化の物理的基盤と適応メカニズムを解明したことを示しています。
Ancestral secretory programs underlie the evolution of morphological innovations across Spiralia
本研究は、単細胞トランスクリプトーム解析を用いて、二枚貝の貝殻形成細胞が祖先的な上皮分泌プログラムを基盤として進化し、既存の遺伝的枠組みの再利用と新規遺伝子の獲得によって多様化してきたことを明らかにした。
Stranger Swings: Temperature-Dependent Upsides and Downsides of a Densovirus in Aedes albopictus
この研究は、白紋シマカ（Aedes albopictus）の生物学的防除候補であるデノソウイルス（AalDV2）が、高温ストレス下では生存率を向上させる一方で、発育遅延や成虫サイズの縮小といった適応コストをもたらすという、温度依存性の複雑な相互作用を初めて明らかにしたものである。
Thermoregulatory Constraints on Regenerative Competence: Evolutionary Trade-Offs Between Metabolic Homeostasis and Tissue Repair
この論文は、恒温動物における組織再生能力の低下が、熱産生のために特殊化したカルシウム調節機構によって炎症や線維化が誘導される結果であり、代謝の制約そのものではなく局所的なカルシウムシグナリングの進化が再生能を決定づけたとする「再生範囲の体温調節理論」を提唱している。
Trait evolution with incomplete lineage sorting and gene flow: the Gaussian Coalescent model
本論文は、不完全系統分岐（ILS）や遺伝子流動を考慮し、系統樹上の形質進化をより正確に記述するための「ガウス共分岐モデル（Gaussian Coalescent）」を提案し、その分散行列の効率的な計算手法とシミュレーションおよび実データによる有効性を示しています。
An accessible transfection protocol for choanoflagellates
この論文は、高価な市販試薬に依存していたホオズキムシの遺伝子操作を、安価な自家製電穿孔緩衝液を用いることで代替可能にし、動物の起源研究への参加を促進する新しいプロトコルを確立したことを報告しています。
Most Beefalo cattle have no detectable bison genetic ancestry
この論文は、ゲノム解析を用いてビーファロ（アメリカンビーソンとウシの交雑種）の遺伝的構成を調査した結果、その大部分にビーソンの遺伝子形質が検出されず、ブリーダー協会が定める基準が事実と異なる可能性を示唆していることを報告しています。
Extinction vortices are driven more by a shortage of beneficial mutations than by deleterious mutation accumulation
この論文は、絶滅の渦を駆動する要因として、有害な変異の蓄積だけでなく、適応に必要な有益な変異の不足（「変異の干ばつ」）が、特に環境変化下において同程度、あるいはそれ以上に重要であることを示しています。
Dissecting Cold Tolerance in Drosophila ananassae: A Multi-Phenotypic and Bulk Segregant Analysis
本研究は、Drosophila ananassae の複数の冷耐性表現型を評価し、極端な表現型を示す系統を用いたバルクセグレーション分析により、筋肉の発達や代謝過程などに関与する 16 のゲノム領域を同定することで、自然集団における冷耐性の遺伝的基盤を解明しました。
Ancestral splice variation is a substrate for rapid diversifcation in African cichlids
アフリカのシクリッド魚類の急速な適応放散において、遺伝子発現量の変化よりも「選択的スプライシング（アロナティブスプライシング）」の急速な進化が、祖先から存在する低頻度のアイソフォームの増加や新規アイソフォームの出現を通じて、短時間で多様な生態的適応を可能にした主要な分子メカニズムであることが示されました。
Modular and redundant genomic architecture underlies combinatorial mechanism of speciation and adaptive radiation
この論文は、ビクトリア湖のシクリッド魚類において、過去の交雑によって生じた多様で冗長なゲノムモジュールが、レゴブロックのように組み換えられることで多様な形質の組み合わせが生まれ、超高速な適応放散と種分化を可能にしていることを明らかにしたものである。
Reproduction emerges from ecological interactions at the onset of multicellularity
この研究は、計算モデルを用いて、単細胞生物が環境と相互作用する生態学的プロセスが、多細胞生物における分散を目的とした生殖（胞子形成）という発生プログラムとして再編成（コオプテーション）されることで、多細胞性の起源において生殖がどのように進化したかを解明しました。
diempy: fast and reference-free genome polarisation
この論文は、参照パネルを必要とせず集団構造や交雑を推定できるアルゴリズム「diem」の効率的な Python 実装「diempy」を紹介し、その高速なデータ変換、柔軟な処理機能、および可視化ツールが参照フリーのゲノム極性解析を現実的かつ再現性のあるものにする点を述べています。
Asymmetric biparental but inefficient horizontal transmission of paralysis-causing sigmavirus in Queensland fruit fly
オーストラリアの主要果樹害虫であるミカンミバエ（Bactrocera tryoni）に感染するシグマウイルス（BtSV）は、母系伝播が父系伝播よりも効率的で、水平伝播も低濃度で起こるが、二酸化炭素曝露時に麻痺や死亡を引き起こすことが明らかになった。
Sexually antagonistic environments and the stability of environmental sex determination
この論文は、環境条件が両性の適応度に異なる影響を与える「チャーンボウ効果」の具体的な機能形式が、環境性決定（ESD）システムの進化動態や安定性、および性バイアス遺伝子の侵入運命に決定的な役割を果たすことを示している。
Pervasive positive selection on X-linked ampliconic genes in primates
本研究は、テロメアからテロメアまでの完全なゲノム配列を用いて霊長類の性染色体を解析し、X 染色体上のアンプリコニック遺伝子群が精子競争や性比駆動などの要因により広範な正の選択を受けながら急速に進化している一方、Y 染色体上の同様の遺伝子群は主に純化選択下にあることを明らかにしました。
Experimental evolution reveals bifunctional genetic solutions to loss of trpF in Salmonella enterica
この研究は、実験進化を用いて Salmonella enterica の trpF 遺伝子欠損を回復させた結果、遺伝子重複ではなく hisA または trpA 遺伝子における点変異によって、祖先機能を維持しつつ新たな機能を獲得する二機能性の遺伝的解決策が複数経路で生じ得ることを実証しました。
A ribozyme mass extinction at the RNA-cellular boundary and its potential imprint on the genetic code
この論文は、約 39 億〜38 億年前の地化学的変化によりリボザイムに大規模な絶滅が発生し、その生存者である「ハマーヘッド型リボザイム」などの生態学的特性が遺伝暗号の形成に決定的な影響を与え、遺伝暗号の起源を単なる化学的必然性ではなく、絶滅を生き延びた生物の生態的遺産として再定義する仮説を提唱しています。